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液相色谱质谱仪该系统集成了质谱仪（MS）和高性能液相色谱仪。通过窄分离管（液相色谱装置中称为分离柱）后，样品被分离，且会显示一组峰值。通过观察色谱峰值即可确定每种组分的分子量。比较峰面积与参考标准面积，可确定化合物的分子量。另外还可使挥发性或热不稳定化合物、气相色谱质谱仪中的不确定组分得以分析。
